Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrn3B2RS91 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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