Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8nlA2ABX0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms