Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Pramef6A2A8M8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pramef6A2A8M8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms