Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psma1Q9R1P4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms