Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc5Q9QX29 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms