Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nectin3Q9JLB9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nectin3Q9JLB9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nectin3Q9JLB9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nectin3Q9JLB9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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