Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms