Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Swt1Q9DBQ9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms