Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Abcg8Q9DBM0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms