Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Med27Q9DB40 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Med27Q9DB40 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Med27Q9DB40 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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