Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc89Q9DA73 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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