Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms