Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Snx5Q9D8U8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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