Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chmp4cQ9D7F7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms