Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srp19Q9D7A6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms