Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms