Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms