Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ss18l2Q9D174 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Ss18l2Q9D174 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms