Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9CYI0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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