Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RpainQ9CWY9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RpainQ9CWY9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RpainQ9CWY9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RpainQ9CWY9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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