Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnaseh2cQ9CQ18 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms