Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Brms1Q99N20 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brms1Q99N20 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms