Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Apobec3Q99J72 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Apobec3Q99J72 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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