Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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SptssbQ925E8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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