Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb6Q922F4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms