Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf6Q91YR7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms