Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxc12Q8K5B8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxc12Q8K5B8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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