Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Vmn1r188Q8K3N2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r188Q8K3N2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Vmn1r188Q8K3N2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Vmn1r188Q8K3N2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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