Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prpf39Q8K2Z2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms