Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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SbsnQ8CIT9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbsnQ8CIT9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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