Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm28Q8CGC6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm28Q8CGC6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms