Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms