Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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