Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Strip1Q8C079 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Strip1Q8C079 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms