Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cep55Q8BT07 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cep55Q8BT07 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep55Q8BT07 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms