Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms