Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms