Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sgo2Q7TSY8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo2Q7TSY8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms