Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shq1Q7TMX5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms