Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup98Q6PFD9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms