Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrimpolQ6P1E7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrimpolQ6P1E7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms