Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Zfp248Q640N4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Zfp248Q640N4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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