Protein–RNA interactions for Protein: Q61321

Six4, Homeobox protein SIX4, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six4Q61321 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Six4Q61321 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Six4Q61321 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms