Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nell2Q61220 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nell2Q61220 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms