Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms