Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms