Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Fam220aQ3ZN08 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Fam220aQ3ZN08 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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