Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Prdm6Q3UZD5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prdm6Q3UZD5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms