Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp30Q3UN04 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms