Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssbp4Q3U4B1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms